Mette Kalager (født 1967) er en norsk lege og professor i medisin og epidemiologi ved Universitetet i Oslo (UiO) og forsker ved Oslo universitetssykehus (OUS). Hun leder forskergruppen for klinisk effektforskning ved Institutt for helse og samfunn på UiO.

Kalager er særlig kjent for sin forskning på screeningprogrammer for kreft, spesielt mammografi, hvor hun har dokumentert utfordringer knyttet til overdiagnostikk. Hun har også vært en tydelig stemme i samfunnsdebatten, blant annet under koronapandemien, der hun stilte kritiske spørsmål ved enkelte smitteverntiltak og myndighetenes beslutningsgrunnlag.

I tillegg til sin akademiske rolle er Kalager medisinsk redaktør i Tidsskrift for Den norske legeforening og leder for Foreningen for leger i vitenskapelige stillinger (LVS).